O município de Varjão surgiu da divisão primitiva que se procedeu na região durante o ano de 1925. Sua primeira denominação foi Fazenda Salobro. Em 1933 os moradores José Vieira da Silva, José Ferreira da Silva e Ana Elísia, doaram área de terra para a formação do patrimônio. As terras estavam localizadas na Fazenda Vargem Grande, topônimo adotado pelos moradores em substituição à Fazenda Salobro.
Por volta de 1940 o local ganhou o nome definitivo de Varjão, pertencente ao município de Santo Antônio das Grimpas (Hidrolândia). Em 1948, depois de ter pertencido ao recém-criado município de Goiânia, Varjão foi anexado a Guapó. Sua elevação à categoria de Distrito aconteceu em 1953. Sua emancipação se deu em 14 de novembro de 1958.
Está a 64 quilômetros de Goiânia. É servido pelas GOs, 416 e 319 e pela BR 060.
A base econômica de Varjão está na agropecuária. A agricultura produz milho, soja e arroz em grande quantidade e a pecuária, gados de leite e corte. A indústria é representada por uma fábrica de queijo e uma olaria.
Dentre os principais eventos populares de Varjão destacam-se a festa de Nossa Senhora de Abadia, padroeira do município, celebrada em 15 de agosto, e a São Sebastião, em janeiro. O principal ponto turístico do município é o ribeirão Salobro de Cima, dotado de uma pedreira que forma cascatas de rara beleza.