A história de Quirinópolis começou com a vinda da família de desbravadores de João Crisóstomo de Oliveira que partiu de Ouro Preto em 1832 e fixou-se entre o Córrego Água Limpa e o Rio São Francisco, tomando posse de vasta extensão de terras, onde fixou residência, construindo grande fazenda.
Em 1843 José Vicente de Lima e José Ferreira de Jesus e sua mulher Maria Jacinta Oliveira doaram uma faixa de terra à Igreja Católica, originando o povoado de Abadia do Paranaíba, recebendo posteriormente o nome de Nossa Senhora D’Abadia.
Em de 29 de Julho 1879 foi elevada à categoria de Freguesia, com o nome de Nossa Senhora D’Abadia ou Capelinha. A primeira Capela construída, aos poucos foi abandonada por localizar-se em área de baixada. Em 1910, foi demolida por José Quirino Cardoso, que construiu a atual Velha Matriz, mais uma vez com o auxílio do povoado.
A freguesia de Nossa Senhora tornou-se distrito de Rio Verde em 10 de Julho de 1894, e em 24 de Fevereiro de 1931, recebeu o nome de Quirinópolis, em homenagem a José Quirino. Finalmente em de Dezembro de 1943, foi elevada à categoria de cidade, desmembrando-se do Município de Rio Verde cuja emancipação ocorreu no dia 22 de Janeiro de 1944.